Friedrich-Schiller University Jena offers the following position:
PostDoc/PhD student as a research associate (Wissenschaftlicher Mitarbeiter)
This position is part of the project Algorithms for the Analysis of
Approximate Gene Clusters, funded by the Deutsche
Forschungsgemeinschaft. The key objective of this project is to develop
models and algorithms for the computation of approximate gene clusters,
that combine a formal strictness with applicability to biological data.
We will combine methods from combinatorial optimization and algorithmic
graph theory with a statistically sound evaluation. Focus of research
is, besides developing such algorithms, also their implementation,
evaluation, algorithm engineering, and biological case studies.
Applicants for this project must have or be about to obtain a Master's
degree or a qualification equivalent to the German Diploma in
bioinformatics, computer science, or mathematics. The applicant should
have an excellent background in algorithmics. Introductory course level
knowledge or better in biology and molecular biology is required. Good
programming skills are required, and experience in software design would
be helpful.
Salary is according to Entgeltgruppe 13 TV-L, either a full position
(for PostDocs) or 3/4 position (for PhD students). This position is a
temporary appointment.
Handicapped applicants will be given preference in case of equal
qualifications.
This project is realized in cooperation with the AG Genome Informatics
of Prof. Dr. Jens Stoye at Bielefeld University, Germany.
Please send your application with the usual documents (CV, list of
publications, copies of certificates, in paper or via email) until
January 25th 2010 to:
Prof. Dr. Sebastian B�cker
Friedrich-Schiller-Universit�t Jena
Institut f�r Informatik
Lehrstuhl f�r Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany
If you apply for a position in both projects IDUN and 3AGC, please
clearly say so in your cover letter.
http://bio.informatik.uni-jena.de/jobs/mitarbeiter-3agc/
Am Lehrstuhl f�r Bioinformatik, Institut f�r Informatik der
Friedrich-Schiller Universit�t Jena ist zum n�chstm�glichen Zeitpunkt
die Stelle eines
Wissenschaftlichen Mitarbeiters (Post-Doktorand oder Doktorand)
zu besetzen. Die Stelle ist Teil des von der DFG gef�rderten Projekts
Algorithmen zur Analyse Approximativer Gen-Cluster. Im Rahmen dieses
Projektes sollen Modelle und Algorithmen f�r die Berechnung
approximativer Gencluster entwickelt werden, die eine formale Strenge
mit der Anwendbarkeit auf biologische Daten verbinden. Wir wollen f�r
diese Aufgabe Methoden der kombinatorischen Optimierung und der
Graphentheorie mit einer soliden statistischen Evaluation
verbinden.Fokus der Forschung sind, neben der Entwicklung solcher
Algorithmen, auch ihre Implementierung, Evaluierung, Algorithm
Engineering sowie biologische Fallstudien.
Bewerber m�ssen �ber ein abgeschlossenes Diplom- oder Master-Studium in
den Bereichen Bioinformatik, Informatik oder Mathematik verf�gen, oder
ein solches Studium in n�chster Zukunft abschließen. Notwendig sind sehr
gute Kenntnisse in Bereich Algorithmik sowie Grundkenntnisse in den
Bereichen Biologie und Molekularbiologie. Grundkenntnisse in
(algorithmischer) Massenspektrometrie w�nschenswert. Die Projektarbeit
erfordert gute Programmierkenntnisse, Erfahrung im Bereich Software
Design ist w�nschenswert.
Die Verg�tung erfolgt gem�ß Entgeltgruppe 13 TV-L, es handelt sich um
volle Stellen (f�r Post-Doktoranden) bzw. 3/4 Stellen (f�r Doktoranden).
Die M�glichkeit zur wissenschaftlichen Qualifikation wird geboten. Die
Stelle ist befristet.
Beitr�ge zur Lehre der Studieng�nge Bioinformatik (Diplom, B.Sc., M.Sc.)
werden in geringen Umfang erwartet.
Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung, Bef�higung und fachlicher
Qualifikation bevorzugt ber�cksichtigt.
Dieses Projekt wird in Kooperation mit der AG Genominformatik von Prof.
Dr. Jens Stoye an der Universit�t Bielefeld durchgef�hrt.
Bewerbungen mit den �blichen Unterlagen (Lebenslauf, Publikationsliste,
Zeugniskopien) sind bis zum 25.01.2010 (in Papierform oder elektronisch)
einzureichen bei:
Prof. Dr. Sebastian B�cker
Friedrich-Schiller-Universit�t Jena
Institut f�r Informatik
Lehrstuhl f�r Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany
Bei einer Bewerbung auf eine Stelle in beiden Projekten IDUN und 3AGC
sollte dieser Umstand im Anschreiben klar erw�hnt werden.
http://bio.informatik.uni-jena.de/jobs/mitarbeiter-3agc/
--
Prof. Dr. Sebastian Boecker, Lehrstuhl fuer Bioinformatik
Institut fuer Informatik, Friedrich-Schiller-Universitaet Jena
Ernst-Abbe-Platz 2, 07743 Jena, Germany
Office 3405, Phone +49 (0)3641 9-46451, Fax +49 (0)3641 9-46452
http://bio.informatik.uni-jena.de/
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