Friedrich-Schiller University Jena offers the following positions:
Two positions PostDoc/PhD students as research associates
(Wissenschaftliche Mitarbeiter)
This position is part of the project Identifying the Unknowns: Towards
structural elucidation of small molecules using mass spectrometry,
funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft. The key objective of this
project is to develop computational methods to "identify the unknowns"
using mass spectrometry, that is, compounds that cannot be found in any
database. For this, we will develop new computational techniques,
models, and algorithms for the interpretation of MS fragmentation data
from small molecules. Focus of research is, besides developing such
algorithms, also their implementation, evaluation, algorithm
engineering, and case studies.
Applicants for this project must have or be about to obtain a Master's
degree or a qualification equivalent to the German Diploma in
bioinformatics, computer science, or mathematics. The applicant should
have an very good background in algorithmics. Introductory course level
knowledge or better in biology and molecular biology is required. Basic
knowledge in (computational) mass spectrometry is helpful. Good
programming skills are required, and experience in software design would
be helpful.
Salary is according to Entgeltgruppe 13 TV-L, either a full position
(for PostDocs) or 3/4 position (for PhD students). This position is a
temporary appointment.
Handicapped applicants will be given preference in case of equal
qualifications.
Please send your application with the usual documents (CV, list of
publications, copies of certificates, in paper or via email) until
January 25th 2010 to:
Prof. Dr. Sebastian B�cker
Friedrich-Schiller-Universit�t Jena
Institut f�r Informatik
Lehrstuhl f�r Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany
If you apply for a position in both projects IDUN and 3AGC, please
clearly say so in your cover letter.
Am Lehrstuhl f�r Bioinformatik, Institut f�r Informatik der
Friedrich-Schiller Universit�t Jena ist zum n�chstm�glichen Zeitpunkt
die Stellen
zweier Wissenschaftlicher Mitarbeiter (Post-Doktoranden oder Doktoranden)
zu besetzen. Die Stelle ist Teil des von der DFG gef�rderten Projekts
Identifying the Unknowns: Massenspektrometrische Identifikation kleiner
Molek�le. Im Rahmen dieses Projektes sollen informatische Methoden
entwickelt werden, um unbekannte Substanzen durch Massenspektrometrie zu
identifizieren, die in keiner Datenbank gefunden werden k�nnen. Wir
wollen f�r diese Aufgabe neue Modelle und Algorithmen entwickeln, um MS
Fragmentierungsdaten kleiner Molek�le interpretieren zu k�nnen. Fokus
der Forschung sind, neben der Entwicklung solcher Algorithmen, auch ihre
Implementierung, Evaluierung, Algorithm Engineering sowie Fallstudien.
Bewerber m�ssen �ber ein abgeschlossenes Diplom- oder Master-Studium in
den Bereichen Bioinformatik, Informatik oder Mathematik verf�gen, oder
ein solches Studium in n�chster Zukunft abschlie�en. Notwendig sind sehr
gute Kenntnisse in Bereich Algorithmik sowie Grundkenntnisse in den
Bereichen Biologie und Molekularbiologie. Grundkenntnisse in
(algorithmischer) Massenspektrometrie w�ren w�nschenswert. Die
Projektarbeit erfordert gute Programmierkenntnisse, Erfahrung im Bereich
Software Design ist w�nschenswert.
Die Verg�tung erfolgt gem�� Entgeltgruppe 13 TV-L, es handelt sich um
volle Stellen (f�r Post-Doktoranden) bzw. 3/4 Stellen (f�r Doktoranden).
Die M�glichkeit zur wissenschaftlichen Qualifikation wird geboten. Die
Stelle ist befristet.
Beitr�ge zur Lehre der Studieng�nge Bioinformatik (Diplom, B.Sc., M.Sc.)
werden in geringen Umfang erwartet.
Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung, Bef�higung und fachlicher
Qualifikation bevorzugt ber�cksichtigt.
Bewerbungen mit den �blichen Unterlagen (Lebenslauf, Publikationsliste,
Zeugniskopien) sind bis zum 25.01.2010 (in Papierform oder elektronisch)
einzureichen bei:
Prof. Dr. Sebastian B�cker
Friedrich-Schiller-Universit�t Jena
Institut f�r Informatik
Lehrstuhl f�r Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany
Bei einer Bewerbung auf eine Stelle in beiden Projekten IDUN und 3AGC
sollte dieser Umstand im Anschreiben klar erw�hnt werden.
--
Prof. Dr. Sebastian Boecker, Lehrstuhl fuer Bioinformatik
Institut fuer Informatik, Friedrich-Schiller-Universitaet Jena
Ernst-Abbe-Platz 2, 07743 Jena, Germany
Office 3405, Phone +49 (0)3641 9-46451, Fax +49 (0)3641 9-46452
http://bio.informatik.uni-jena.de/
Posts
