Wednesday, November 7, 2012

[DMANET] two PostDoc/PhD positions in Bioinformatics/Parameterized Algorithms at FSU Jena

Deutsche Ausschreibung siehe unten.

The Chair for Bioinformatics, Institute of Computer Science at the
Friedrich-Schiller University Jena offers the following positions:

Two PostDocs/PhD students as research associates (Wissenschaftlicher
Mitarbeiter)

The positions are part of the project "Parameterized Algorithmics for
Bioinformatic", funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft. Scope of
this project is to develop efficient algorithms for NP-hard
bioinformatics problems, in particular using parameterized algorithmics.
Focus of research is, besides developing such algorithms, also their
implementation, evaluation, algorithm engineering, and biological case
studies. Other methods for solving NP-hard optimization problems, such
as Integer Linear Programming, will also be considered.

Requirements for PhD students: Applicants for this project must have or
be about to obtain a Master's degree or a qualification equivalent to
the German Diploma in bioinformatics, computer science, or mathematics.
The applicant should have an very good background in algorithmics.
Introductory course level knowledge or better in biology and molecular
biology is required. Good programming skills are required, and
experience in software design would be helpful.

Requirements for Postdocs: Applicants for this project must have a PhD
in bioinformatics, computer science, or mathematics. It is required that
the applicant has research experience in developing paramterized
algorithms, preferably for bioinformatics problems, documented by
publications in scientific journals or conference proceedings.

Salary is according to Entgeltgruppe 13 TV-L, either a full position
(for PostDocs) or 3/4 position (for PhD students). These positions are
temporary appointments.

Handicapped applicants will be given preference in case of equal
qualifications.

Please send your application with the usual documents (CV, list of
publications, copies of certificates, preferred via email) until
December 7th 2012 to:

Kathrin Schowtka

Friedrich-Schiller-Universität Jena
Institut für Informatik
Lehrstuhl für Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany


Am Lehrstuhl für Bioinformatik, Institut für Informatik der
Friedrich-Schiller Universität Jena ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt
die Stellen zweier

Wissenschaftlicher Mitarbeiter (Post-Doktorand oder Doktorand)

zu besetzen. Die Stellen sind Teil des von der DFG geförderten Projekts
Parametrisierte Algorithmik bioinformatischer Probleme. Im Rahmen dieses
Projektes sollen effiziente Algorithmen, insbesondere aus dem Bereich
der parametrischen Algorithmik, für NP-schwere Probleme der
Bioinformatik entwickelt werden. Fokus der Forschung sind, neben der
Entwicklung solcher Algorithmen, auch ihre Implementierung, Evaluierung,
Algorithm Engineering und biologische Fallstudien. Im Projekt sollen, wo
dies möglich ist, auch andere informatische Methoden zu lösen
NP-schwerer Optimierungsprobleme zum Einsatz kommen (beispielsweise
Integer Linear Programming).

Anforderungen für Doktoranden. Bewerber müssen über ein abgeschlossenes
Diplom- oder Master-Studium in den Bereichen Bioinformatik, Informatik
oder Mathematik verfügen, oder ein solches Studium in naher Zukunft
abschließen. Notwendig sind sehr gute Kenntnisse in Bereich Algorithmik
sowie Grundkenntnisse in den Bereichen Biologie und Molekularbiologie.
Die Projektarbeit erfordert gute Programmierkenntnisse, Erfahrung im
Bereich Software Design ist wünschenswert.

Anforderungen für Post-Doktoranden. Bewerber müssen über eine
abgeschlossene Promotion in den Bereichen Bioinformatik, Informatik oder
Mathematik verfügen, oder ihre Dissertation bereits eingereicht haben.
Für Post-Doktoranden zwingend erforderlich sind Vorarbeiten im
Forschungsbereich parameterisierter Algorithmen, vorzugsweise für
bioinformatische Probleme, nachgewiesen durch Publikationen in
Fachzeitschriften oder Konferenz-Proceedings.

Die Vergütung erfolgt gemäß Entgeltgruppe 13 TV-L, es handelt sich um
volle Stellen (für Post-Doktoranden) bzw. 3/4 Stellen (für Doktoranden).
Die Möglichkeit zur wissenschaftlichen Qualifikation wird geboten. Die
Stellen sind befristet.

Beiträge zur Lehre der Studiengänge Bioinformatik (Diplom, B.Sc., M.Sc.)
werden in geringen Umfang erwartet.

Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher
Qualifikation bevorzugt berücksichtigt.

Bewerbungen mit den üblichen Unterlagen (Lebenslauf, Publikationsliste,
Zeugniskopien) sind vorzugsweise via EMail bis zum 7.12.2012
einzureichen bei:

Kathrin Schowtka

Friedrich-Schiller-Universität Jena
Institut für Informatik
Lehrstuhl für Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany

--
Prof. Dr. Sebastian Boecker, Lehrstuhl fuer Bioinformatik
Institut fuer Informatik, Friedrich-Schiller-Universitaet Jena
Ernst-Abbe-Platz 2, 07743 Jena, Germany
Office 3405, Phone +49 (0)3641 9-46451, Fax +49 (0)3641 9-46452
http://bio.informatik.uni-jena.de/
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*
* Contributions to be spread via DMANET are submitted to
*
* DMANET@zpr.uni-koeln.de
*
* Replies to a message carried on DMANET should NOT be
* addressed to DMANET but to the original sender. The
* original sender, however, is invited to prepare an
* update of the replies received and to communicate it
* via DMANET.
*
* DISCRETE MATHEMATICS AND ALGORITHMS NETWORK (DMANET)
* http://www.zaik.uni-koeln.de/AFS/publications/dmanet/
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